皇家北京大学经过一年多的筹建，高端大气的教舍规划、优美的校园环境放到400年后也不逊色。各种硬件软件、设施设备更是齐全完备，可容纳4万名师生就读。

皇家北京大学定位为国际一流的综合性大学。设置科学院、文学院、数学院、法学院、医学院、外语学院、行政学院、教育学院、历史学院、物理学院、机械学院、化工学院、生物学院、天文学院、地理学院、美术学院、戏曲学院、农业学院、工业学院、冶金学院、商业学院、轻工学院、建筑学院、船舶学院、交通学院等学院。

奇技淫巧研发部升级为科学院，西学研究部升级为外语学院，教育研究部升级为教育学院，机械研究部和钟表研究部升级为机械学院。

化工研究部升级为化工学院，地图勘测研究部升级为地理学院、美工部升级为美术学院，戏曲研究部升级为戏曲学院，农学研究部升级为农业学院，玻璃研究部和冶金研究部升级为冶金学院，建筑研究部升级为建筑学院。

食品研究部和纺织研究部以及服饰研究部升级为轻工学院，船舶研究部升级为船舶学院，四轮马车研究部和自行车研究部升级为交通学院。

油气研究部升级为油气学院，电力研究部升级为电力学院。原各部部长、副部长升级为院长、副院长。

朱由校担任第一任校长，刘宗周担任执行校长，黄道周担任执行副校长。凤国忠、花国君、方国爱、俞国务、任国实、袁国兴、柳国邦、酆国圆、鲍国国、史国强、唐国民、费国富、廉国铸、岑国东、薛国方、雷国盛、贺国世等教导队优秀队员负责政治思想教育。

随着管理队伍、教师队伍的培训完成，皇家北京大学开始招生，拟定于天启元年正月初10正式开学。

皇家北京大学的第一批生员，招收全国的所有举人。大明全国的举人除55岁以上以及体弱多病不能长途跋涉的外，约人全部强制到皇家北京大学报到，接受再教育学习。

14岁以上未婚的皇族宗室子女、勋贵子女以及优秀的年轻女性，只要有一定的文化基础均可报名，但必须参加入学考试。一经录取，皇族宗室子女、勋贵子女仅保留爵位封号的名誉，自愿放弃其它所有待遇。

高等学府必须要有青春靓丽的女学生，才有活力。男女搭配，干活不累。

所有入读的学生必须进行严格的政审，学生本人有违法犯罪行为的，道德品质败坏的，三代内直系亲属有违法犯罪行为的不予录取。

凡是入读皇家北京大学的学生，包吃包穿包住包分配工作，学制3年，毕业考核合格后，享受进士待遇，由朝廷统一安排工作。学习期间也可以在京城参加会试，直接考取进士。

北京医学院经过两年的发展，聚集了大明上千名优秀的医生，近万名医护学员正在接受深造学习，大明的医疗卫生事业得到飞速发展。

青霉素、黄连素、阿司匹林、金鸡纳霜通过临床试验，开始进行临床治疗。

北京医学院附属医院开始全面筹建，拟于天启元年正月开门营业。