司设监专责掌管管理卤簿、仪仗、雨具、大伞等，事繁且杂，无实权。

御马监专责掌管腾骧四卫营、马匹及象房等事。

神官监专责掌管太庙洒扫、香灯等事。

尚膳监专责掌管皇帝及宫廷膳食及筵席等事。

尚宝监专责掌管宝玺、敕符、将军印信。

印绶监专责掌管古今通集、铁券、诰敕、贴黄、印信、勘合、符验、信符等。

直殿监负责掌管各殿及廊庑扫除。

尚衣监负责掌管皇帝所用冠冕、袍服及履舄、靴袜。

都知监负责掌管随皇帝出行近身侍卫警戒、清道止行。

惜薪司负责掌管宫内所用薪炭。宝钞司负责制造粗细草纸。钟鼓司负责宫内乐舞、演戏、杂耍等事，首要职责是出朝钟鼓。混堂司负责宫内沐浴事务。

兵仗局负责掌管制造军用器械和宫中零用铁器。针工局负责造宫中衣物。

巾帽局负责掌管造宫内使帽靴，驸马冠靴及藩王诸旗尉帽靴。

内织染局负责掌管染造皇帝及宫廷所用缎匹，附属机构有在城西的蓝靛厂。

酒醋面局负责掌管宫廷食用酒醋、粮酱、面豆等物。与御酒房不相统辖。司苑局负责掌管宫中所需蔬菜、瓜果。

银作局负责掌管打造金银器饰。浣衣局专为宫内皇亲国戚提供洗衣服务，位于德胜门以西,是二十四衙门中唯一不在皇城中的机构。

皇城里的内承运库、广惠库、东裕库三大府库，由内廷衙门掌管，存放着大明大量的财富、物资，万历皇帝的内帑家产也全部存放于此。

内承运库又称为国库，共有十库。

甲字库存放布匹、颜料，属于户部。乙字库存放胖袄、战鞋、军士裘帽，属于兵部。丙字库存放棉花、丝纩，属于户部。丁字库存放铜铁、兽皮、苏木，属于户部。戊字库存放甲仗，属于工部。